Next generation sequencing services for DECIDER

hankintailmoitus (2023-03-17)
Kohde
Hankinnan laajuus
Otsikko: Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut
Lyhyt kuvaus:
“The following services will be purchased in two separate lots where providers can differ. Firstly, high-throughput sequencing for Whole Genome sequencing...”    Näytä lisää
Ilmoituksen metatiedot
Alkukieli: englanti 🗣️
Asiakirjatyyppi: hankintailmoitus
Sopimuksen luonne: Palvelut
Asetus: Euroopan unioni ja WTO-maat
Yhteinen hankintanimikkeistö (CPV)
Koodi: Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut 📦
Lisä-CPV-koodi: Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut 📦
Suorituspaikka
NUTS-alue: Helsinki-Uusimaa 🏙️

Menettely
Menettelyn tyyppi: Avoin menettely
Tarjouksen tyyppi: Tarjous koskee kaikkia eriä
Myöntämisperusteet
Kokonaistaloudellisesti edullisin tarjous

Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Maa: Suomi 🇫🇮
Hankintaviranomaisen tyyppi: Julkisoikeudellinen yhteisö
Hankintaviranomaisen nimi: Helsingin yliopisto
Postiosoite: Yliopistonkatu 3
Postinumero: 00014
Postitoimipaikka: Helsingin yliopisto
Yhteystiedot
Internetosoite: https://www.helsinki.fi/fi 🌏
Sähköposti: hankinnat@helsinki.fi 📧
Asiakirjojen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/helsinginyliopisto?id=430578&tpk=78c7186a-91a4-4313-9d14-3ff55642829f 🌏
Osallistumisen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/helsinginyliopisto?id=430578&tpk=78c7186a-91a4-4313-9d14-3ff55642829f 🌏

Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2023-03-17 📅
Tarjousten jättämisen määräaika: 2023-04-17 📅
Julkaisupäivä: 2023-03-22 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2023/S 058-170281
EUVL-S-numero: 58

Kohde
Hankinnan laajuus
Lyhyt kuvaus:
“The following services will be purchased in two separate lots where providers can differ. Firstly, high-throughput sequencing for Whole Genome sequencing...”    Näytä lisää

“In the first part, estimated samples per year for WGS is 100-200, for RNA-seq 100-150 and for WGBS ~50. These samples are provided as extracted DNA and RNA....”    Näytä lisää

Näytä lisää (2)

“The study is part of an ongoing EU project DECIDER led by Professor Sampsa Hautaniemi at the University of Helsinki. The project builds on existing data...”

Lyhyt kuvaus

The study is part of an ongoing EU project DECIDER led by Professor Sampsa Hautaniemi at the University of Helsinki. The project builds on existing data received from previous sequencing for this project which was produced according to the procedures described in the invitation to tender section VI.4) Other information: "Content of the services", and thus the sequencing data purchased from the service provider(s) should be compatible with these data types.

   Näytä lisää

“An agreement starting in July 2023 and lasting 31 months will be signed of the services. One or many services will be ordered in smaller batches. For each...”

Lyhyt kuvaus

An agreement starting in July 2023 and lasting 31 months will be signed of the services. One or many services will be ordered in smaller batches. For each order a separate sub-agreement needs to be prepared and signed to define requested services, number of samples, up-to-date prices and deadline for data delivery.

   Näytä lisää

Arvioitu kokonaisarvo: 490 000 EUR 💰
Osan nimi: Lot 1. Library preparation and high-throughput sequencing for whole-genome, whole-genome bisulfite and RNA sequencing
Osan numero: 1
Lyhyt kuvaus:
“The following services will be purchased. High-throughput sequencing for Whole Genome sequencing (WGS), Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS), and RNA...”    Näytä lisää

“Estimated sample number per year for WGS is 100-200 and RNA-seq are 100-150 per year and for WGBS ~50 per year. These samples are provided as extracted DNA and RNA.”    Näytä lisää

Näytä lisää (1)

“An agreement starting at July 2023 and lasting 31 months will be signed of the services. One or many services will be ordered in smaller batches. For each...”

Lyhyt kuvaus

An agreement starting at July 2023 and lasting 31 months will be signed of the services. One or many services will be ordered in smaller batches. For each order a separate sub-agreement needs to be prepared and signed to define requested services, number of samples, up-to-date prices and deadline for data delivery.

   Näytä lisää

Arvioitu arvo ilman arvonlisäveroa: 400 000 EUR 💰
Kesto: 31 kuukautta
EU:n rahoittaman hankkeen tai ohjelman nimi: European Union project DEDICER, grant agreement no 965193.
Osan nimi: Lot 2. DNA extraction, quality control, library preparation and high-throughput sequencing of ctDNA-samples for sWGS and WES
Osan numero: 2
Lyhyt kuvaus:
“The following services will be purchased. Circulating tumor DNA (ctDNA) sequencing services including DNA extraction, and high-throughput sequencing for...”    Näytä lisää

“We estimate to sequence ~80 samples for sWGS and ~40 for WES. Since these plasma samples are provided before extraction and may have too low amount of DNA,...”    Näytä lisää

Näytä lisää (1)

“The study is part of an ongoing EU project DECIDER led by Professor Sampsa Hautaniemi at the University of Helsinki. The project builds on existing data...”

Lyhyt kuvaus

The study is part of an ongoing EU project DECIDER led by Professor Sampsa Hautaniemi at the University of Helsinki. The project builds on existing data received from previous sequencing for this project which was produced according to the procedures described in the invitation to tender section VI.4) Other information: "Content of the services", and thus the sequencing data purchased from the service provider(s) should be compatible with these data types, mainly NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit and Novaseq 6000 sequencing.

   Näytä lisää

Arvioitu arvo ilman arvonlisäveroa: 90 000 EUR 💰

Menettely
Oikeusperusta: 32014L0024
Tarjousten vastaanottoaika: 14:00
Kielet, joilla tarjoukset tai osallistumishakemukset voidaan jättää: englanti 🗣️
Tarjouksen voimassaoloaika: 6 kuukautta
Tarjousten avauspäivä: 2023-04-17 📅
Tarjousten avausaika: 14:01

Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Kansallinen rekisterinumero: 0313471-7

Täydentävät tiedot
Arvostelurunko
Nimi: Markkinaoikeus
Postiosoite: Sörnäistenkatu 1
Postitoimipaikka: Helsinki
Postinumero: 00580
Maa: Suomi 🇫🇮
Puhelin: +358 295643300 📞
Sähköposti: markkinaoikeus@oikeus.fi 📧
Internetosoite: http://www.oikeus.fi/markkinaoikeus 🌏
Lähde: OJS 2023/S 058-170281 (2023-03-17)

Lisätietoilmoitus (2023-04-19)
Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2023-04-19 📅
Tarjousten jättämisen määräaika: 2023-04-28 📅
Julkaisupäivä: 2023-04-24 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2023/S 080-241490
EUVL-S-numero: 80
Lisätietoja

“- Removed the uploading requirement from the individual criteria on the scoring table - Added a section to both lots where the document used in the quality...”    Näytä lisää
Lähde: OJS 2023/S 080-241490 (2023-04-19)