Next Generation Sequencing Services for DECIDER

Helsingin yliopisto

The following services will be purchased (estimated number of analysis per year in parentheses).
Quality control measurement, library preparation and high-throughput sequencing for Whole Genome Sequencing (WGS, ~250 samples), Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS, ~100 samples), and RNA sequencing (RNA-seq, ~250 samples) services. DNA extraction, quality control measurement, library preparation and high- throughput sequencing of ctDNA samples for whole-genome shallow sequencing (sWGS, ~100 samples), whole-exome sequencing (WES, ~25 samples) and targeted sequencing including at least exonic regions of 200 cancer-specific genes (~5 samples).
The study is part of an ongoing EU project led by Professor Sampsa Hautaniemi at the University of Helsinki. The project builds on existing data received from previous sequencing projects by EU project HERCULES which was produced according to the procedures described in the invitation to tender section VI.4) Other information: ‘Content of the services’, and thus the sequencing data purchased from the service provider should be compatible with these data types (not applicable to ctDNA-specific sequencing).
An agreement for 2 years will be signed of the services. One or many services will be ordered in smaller batches. For each order a separate sub-agreement needs to be prepared and signed to define requested services, number of samples, up-to-date prices and deadline for data delivery.

Määräaika
Tarjousten vastaanottamisen määräaika oli 2021-04-06. Hankinta julkaistiin 2021-03-04.

Toimittajat
Seuraavat toimittajat mainitaan hankintapäätöksissä tai muissa hankinta-asiakirjoissa:
Kuka?

Mitä?

Missä?

Hankintojen historia
Päivämäärä Asiakirja
2021-03-04 hankintailmoitus
2021-07-26 Ilmoitus tehdystä sopimuksesta
hankintailmoitus (2021-03-04)
Hankintaviranomainen
Nimi ja osoitteet
Nimi: Helsingin yliopisto
Kansallinen rekisterinumero: 0313471-7
Postiosoite: Yliopistonkatu 3
Postitoimipaikka: Helsinki
Postinumero: 00014
Maa: Suomi 🇫🇮
Yhteyshenkilö: Hannele Heinänen
Sähköposti: hannele.heinanen@helsinki.fi 📧
Alue: Manner-Suomi 🏙️
URL: https://www.helsinki.fi/fi 🌏
Viestintä
Asiakirjojen URL-osoite: https://hanki.tarjouspalvelu.fi/hanki?id=336870&tpk=31f10397-8416-4010-b023-3b05dae01918 🌏
Osallistumisen URL-osoite: https://hanki.tarjouspalvelu.fi/hanki?id=336870&tpk=31f10397-8416-4010-b023-3b05dae01918 🌏
Hankintaviranomaisen tyyppi
Muu tyyppi: University

Kohde
Hankinnan laajuus
Otsikko: Next Generation Sequencing Services for DECIDER
Tuotteet/palvelut: Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut 📦
Lyhyt kuvaus:
“The following services will be purchased (estimated number of analysis per year in parentheses). Quality control measurement, library preparation and...”    Näytä lisää
Arvioitu arvo ilman arvonlisäveroa: EUR 850 000 💰
Tietoa eristä
Tarjouksia voidaan jättää kaikista eristä

1️⃣
Hankinnan laajuus
Otsikko:
“Lot 1:Library Preparation and High-throughput Sequencing for Whole-genome, Whole-genome Bisulfite and RNA Sequencing”
Otsikko
Erän tunnistenumero: 1
Kuvaus
Lisätuotteet/palvelut: Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut 📦
Suorituspaikka: Manner-Suomi 🏙️
Hankinnan kuvaus:
“The following services will be purchased (estimated number of analysis per year in parentheses). Quality control measurement, library preparation and...”    Näytä lisää
Myöntämisperusteet
Hinta ei ole ainoa myöntämisperuste, ja kaikki perusteet ilmoitetaan ainoastaan hankinta-asiakirjoissa
Hankinnan laajuus
Arvioitu kokonaisarvo ilman arvonlisäveroa: EUR 570 000 💰
Sopimuksen, puitesopimuksen tai dynaamisen hankintajärjestelmän kesto
Jäljempänä oleva aikataulu on ilmaistu kuukausina.
Kuvaus
Kesto: 24
Hankinnan laajuus
Tietoa Euroopan unionin rahastoista: European Union project DEDICER, grant agreement No 965193.

2️⃣
Hankinnan laajuus
Otsikko:
“Lot 2: DNA Extraction, Quality Control, Library Preparation and High-throughput Sequencing of ctDNA-samples for sWGS, WES and Targeted”
Otsikko
Erän tunnistenumero: 2
Kuvaus
Hankinnan kuvaus:
“The following services will be purchased (estimated number of analysis per year in parentheses). DNA extraction, quality control measurement, library...”    Näytä lisää
Hankinnan laajuus
Arvioitu kokonaisarvo ilman arvonlisäveroa: EUR 280 000 💰

Menettely
Toimenpiteen tyyppi
Avoin menettely
Hallinnolliset tiedot
Tarjousten tai osallistumishakemusten vastaanottamisen määräaika: 2021-04-06 14:00 📅
Kielet, joilla tarjoukset tai osallistumishakemukset voidaan jättää: englanti 🗣️
Jäljempänä oleva aikataulu on ilmaistu kuukausina.
Vähimmäisaika, jonka kuluessa tarjoajan on pidettävä tarjous voimassa: 6
Tarjousten avaamista koskevat ehdot: 2021-04-06 14:01 📅

Täydentävät tiedot
Arvostelurunko
Nimi: Markkinaoikeus
Postiosoite: Radanrakentajantie 5
Postitoimipaikka: Helsinki
Postinumero: 00520
Maa: Suomi 🇫🇮
Puhelin: +358 295643300 📞
Sähköposti: markkinaoikeus@oikeus.fi 📧
URL: http://www.oikeus.fi/markkinaoikeus 🌏
Lähde: OJS 2021/S 047-118211 (2021-03-04)
Ilmoitus tehdystä sopimuksesta (2021-07-26)
Hankintaviranomainen
Nimi ja osoitteet
Postitoimipaikka: Helsingin yliopisto
Alue: Helsinki-Uusimaa 🏙️

Kohde
Hankinnan laajuus
Otsikko: Next Generation Sequencing Services for Decider
Lyhyt kuvaus:
“The following services will be purchased (estimated number of analysis per year in parentheses). Quality control measurement, library preparation and...”    Näytä lisää
Hankinnan kokonaisarvo (ilman arvonlisäveroa): EUR 850 000 💰
Tietoa eristä
Tämä sopimus on jaettu osiin
Hankinnan laajuus
Otsikko:
“Lot 1. Library Preparation and High-throughput Sequencing for Whole-genome, Whole-genome Bisulfite and RNA Sequencing”
Kuvaus
Suorituspaikka: Helsinki-Uusimaa 🏙️
Hankinnan kuvaus:
“The following services will be purchased (estimated number of analysis per year in parentheses). Quality control measurement, library preparation and...”    Näytä lisää
Myöntämisperusteet
Laatukriteeri (nimi): Laatu
Laatukriteeri (painotus): 60
Hinta (painotus): 40
Hankinnan laajuus
Tietoa Euroopan unionin rahastoista: European Union project Dedicer, grant agreement no 965193.
Otsikko:
“Lot 2. DNA Extraction, Quality Control, Library Preparation and High-throughput Sequencing of ctDNA-samples for sWGS, WES and Targeted”
Kuvaus
Hankinnan kuvaus:
“The following services will be purchased (estimated number of analysis per year in parentheses). DNA extraction, quality control measurement, library...”    Näytä lisää

Menettely
Hallinnolliset tiedot
Tätä menettelyä koskeva aiempi julkaisu: 2021/S 047-118211

Sopimuksen tekeminen

1️⃣
Erän tunnistenumero: 1
Otsikko:
“Lot 1. Library Preparation and High-throughput Sequencing for Whole-genome, Whole-genome Bisulfite and RNA Sequencing”
Sopimuksen tekopäivä: 2021-06-23 📅
Tietoa tarjouskilpailuista
Saatujen tarjousten määrä: 3
Pk-yrityksiltä saatujen tarjousten määrä: 2
Muista EU:n jäsenvaltioista tulevilta tarjoajilta saatujen tarjousten määrä: 0
EU:n ulkopuolisista maista tulevilta tarjoajilta saatujen tarjousten määrä: 0
Sähköisesti vastaanotettujen tarjousten määrä: 3
Toimeksisaajan nimi ja osoite
Nimi: Novogene UK Company Ltd
Kansallinen rekisterinumero: GB273975163
Postiosoite: Second Floor, Cambridge Science Park, 25 Milton Road, Cambridge
Postitoimipaikka: CB4 0FW
Postinumero: CB4 0FW
Maa: Iso-Britannia 🇬🇧
Alue: United Kingdom 🏙️
Toimeksisaaja on pk-yritys
Tiedot sopimuksen/erän arvosta (ilman alv:tä)
Hankintasopimuksen/kiinteistön arvioitu kokonaisarvo: EUR 570 000 💰
Sopimuksen/osuuden kokonaisarvo: EUR 569 998 💰

2️⃣
Erän tunnistenumero: 2
Otsikko:
“Lot 2. DNA Extraction, Quality Control, Library Preparation and High-throughput Sequencing of ctDNA-samples for sWGS, WES and Targeted”
Tiedot sopimuksen/erän arvosta (ilman alv:tä)
Hankintasopimuksen/kiinteistön arvioitu kokonaisarvo: EUR 280 000 💰
Sopimuksen/osuuden kokonaisarvo: EUR 280 000 💰
Lähde: OJS 2021/S 146-388123 (2021-07-26)