Quality control measurement, library preparation and high — throughput sequencing for WGS, WES, WGBS, RNA-seq and ChIP-seq and quality control and sequencing services for ATAC-seq and Hi-C

Helsingin yliopisto

Quality control measurement, library preparation and high — throughput sequencing for Whole Genome Sequencing (WGS,~200 samples), Whole Exome Sequencing (WES,~ 50 samples), Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS, ~100 samples), RNA sequencing (RNA-seq, ~200 samples) and Chromatin Immuno-precipitation Sequencing (ChIP-seq, ~500 samples) and quality control measurement and high – throughput sequencing for Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq,~40 samples) and Hi-C (16 samples) services. The study is part of ongoing Academy of Finland Center of Excellence in Tumor Genetics project led by Professor Lauri Aaltonen at the University of Helsinki. The project builds on existing data received from previous sequencing projects by Tumor Genomics laboratory which was produced using Illumina sequencing platform, and thus the sequencing data purchased from the service provider should be compatible with Illumina’s data type.

Määräaika

Tarjousten vastaanottamisen määräaika oli 2018-07-26. Hankinta julkaistiin 2018-06-26.

Toimittajat

Seuraavat toimittajat mainitaan hankintapäätöksissä tai muissa hankinta-asiakirjoissa:

Kuka? Mitä? Missä?
Hankintojen historia
Päivämäärä Asiakirja
2018-06-26 hankintailmoitus
2019-02-01 Ilmoitus tehdystä sopimuksesta
hankintailmoitus (2018-06-26)
Kohde
Hankinnan laajuus
Otsikko: Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut
Lyhyt kuvaus:
Quality control measurement, library preparation and high — throughput sequencing for Whole Genome Sequencing (WGS,~200 samples), Whole Exome Sequencing (WES,~ 50 samples), Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS, ~100 samples), RNA sequencing (RNA-seq, ~200 samples) and Chromatin Immuno-precipitation Sequencing (ChIP-seq, ~500 samples) and quality control measurement and high – throughput sequencing for Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq,~40 samples) and Hi-C (16 samples) services. The study is part of ongoing Academy of Finland Center of Excellence in Tumor Genetics project led by Professor Lauri Aaltonen at the University of Helsinki. The project builds on existing data received from previous sequencing projects by Tumor Genomics laboratory which was produced using Illumina sequencing platform, and thus the sequencing data purchased from the service provider should be compatible with Illumina’s data type.
Näytä lisää
Ilmoituksen metatiedot
Alkukieli: englanti 🗣️
Asiakirjatyyppi: hankintailmoitus
Sopimuksen luonne: Palvelut
Asetus: Euroopan unioni ja WTO-maat
Yhteinen hankintanimikkeistö (CPV)
Koodi: Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut 📦
Suorituspaikka
NUTS-alue: Helsinki-Uusimaa 🏙️

Menettely
Menettelyn tyyppi: Avoin menettely
Tarjouksen tyyppi: Tarjous koskee kaikkia eriä
Myöntämisperusteet
Kokonaistaloudellisesti edullisin tarjous

Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Maa: Suomi 🇫🇮
Hankintaviranomaisen tyyppi: Muu
Hankintaviranomaisen nimi: Helsingin yliopisto
Postiosoite: Fabianinkatu 33
Postinumero: 00014
Postitoimipaikka: Helsingin yliopisto
Yhteystiedot
Internetosoite: https://www.helsinki.fi/fi 🌏
Sähköposti: hankinnat@helsinki.fi 📧
Asiakirjojen URL-osoite: https://hanki.tarjouspalvelu.fi/hanki 🌏
Osallistumisen URL-osoite: https://hanki.tarjouspalvelu.fi/hanki?id=191285&tpk=891ff5fe-aadc-4d51-b6ca-b904b3ed96bd 🌏

Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2018-06-26 📅
Tarjousten jättämisen määräaika: 2018-07-26 📅
Julkaisupäivä: 2018-06-29 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2018/S 123-279575
EUVL-S-numero: 123

Kohde
Hankinnan laajuus
Arvioitu kokonaisarvo: 750 000 EUR 💰
Lyhyt kuvaus:
Quality control measurement, library preparation and high — throughput sequencing for Whole Genome Sequencing (WGS,~200 samples), Whole Exome Sequencing (WES,~ 50 samples), Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS, ~100 samples), RNA sequencing (RNA-seq, ~200 samples) and Chromatin Immuno-precipitation Sequencing (ChIP-seq, ~500 samples) and quality control measurement and high – throughput sequencing for Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq,~40 samples) and Hi-C (16 samples) services.
Näytä lisää
Kesto: 24 kuukautta

Menettely
Tarjousten vastaanottoaika: 14:00
Kielet, joilla tarjoukset tai osallistumishakemukset voidaan jättää: englanti 🗣️
suomi 🗣️
Tarjouksen voimassaoloaika: 6 kuukautta
Tarjousten avauspäivä: 2018-07-26 📅
Tarjousten avausaika: 14:30

Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Kansallinen rekisterinumero: 0313471-7
Muu hankintaviranomaisen tyyppi: University
Yhteystiedot
Asiakirjojen URL-osoite: https://hanki.tarjouspalvelu.fi/hanki 🌏

Täydentävät tiedot
Arvostelurunko
Nimi: Markkinaoikeus
Postiosoite: Radanrakentajantie 5
Postitoimipaikka: Helsinki
Postinumero: 00520
Maa: Suomi 🇫🇮
Puhelin: +358 295643300 📞
Sähköposti: markkinaoikeus@oikeus.fi 📧
Faksi: +358 295643314 📠
Internetosoite: http://www.oikeus.fi/markkinaoikeus 🌏
Lähde: OJS 2018/S 123-279575 (2018-06-26)
Ilmoitus tehdystä sopimuksesta (2019-02-01)
Kohde
Hankinnan laajuus
Lyhyt kuvaus:
Post notice quality control measurement, library preparation and high — throughput sequencing for Whole Genome Sequencing (WGS, ~200 samples), Whole Exome Sequencing (WES, ~50 samples), Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS, ~100 samples), RNA sequencing (RNA-seq, ~200 samples) and Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq, ~500 samples) and quality control measurement and high — throughput sequencing for Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq, ~40 samples) and Hi-C (16 samples) services. The study is part of ongoing Academy of Finland Center of Excellence in Tumor Genetics project led by Professor Lauri Aaltonen at the University of Helsinki. The project builds on existing data received from previous sequencing projects by Tumor Genomics laboratory which was produced using Illumina sequencing platform, and thus the sequencing data purchased from the service provider should be compatible with Illumina’s data type.
Näytä lisää
Hankinnan kokonaisarvo: 750 000 EUR 💰
Ilmoituksen metatiedot
Asiakirjatyyppi: Ilmoitus tehdystä sopimuksesta

Menettely
Tarjouksen tyyppi: Ei sovelleta

Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2019-02-01 📅
Julkaisupäivä: 2019-02-05 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2019/S 025-056165
Viittaa ilmoitukseen: 2018/S 123-279575
EUVL-S-numero: 25

Kohde
Hankinnan laajuus
Lyhyt kuvaus:
Quality control measurement, library preparation and high — throughput sequencing for Whole Genome Sequencing (WGS, ~200 samples), Whole Exome Sequencing (WES, ~50 samples), Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS, ~100 samples), RNA sequencing (RNA-seq, ~200 samples) and Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq, ~500 samples) and quality control measurement and high — throughput sequencing for Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq, ~40 samples) and Hi-C (16 samples) services.
Näytä lisää

Menettely
Myöntämisperusteet
Laatukriteeri (nimi): Quality
Laatukriteeri (painotus): 60
Hinta (painotus): 40

Sopimuksen tekeminen
Sopimuksen tekemispäivä: 2018-11-08 📅
Nimi: Macrogen Inc.
Kansallinen rekisterinumero: 2088124115
Postitoimipaikka: Amsterdam
Maa: Alankomaat 🇳🇱
Extra-Regio NUTS 1 🏙️
Hankinnan kokonaisarvo: 750 000 EUR 💰
Tietoa tarjouskilpailuista
Saatujen tarjousten määrä: 5
Lähde: OJS 2019/S 025-056165 (2019-02-01)
Uudet hankinnat asiaan liittyvissä luokissa 🆕
Aiheeseen liittyvät haut 🔍
Alue:
Suomi/Finland Manner-Suomi Helsinki-Uusimaa
Tuotteet/palvelut:
Terveyspalvelut ja sosiaalitoimen palvelut Terveyspalvelut Erilaiset terveyspalvelut Lääketieteellisten laboratorioiden palvelut