Service for genotyping rainbow trout individuals

Natural Resources Institute Finland

Luke is looking for a service provider for genotyping of rainbow trout individuals with a minimum of 20.000 SNP markers.
The genotyping will be done for a total of 20.000 individuals during 2.5 years from the start of the contract.
One service provider will be selected as a contract supplier.
The procurement may be completely suspended if the budget set by the contracting entity for the procurement is exceeded.

Määräaika

Tarjousten vastaanottamisen määräaika oli 2023-05-29. Hankinta julkaistiin 2023-04-26.

Toimittajat

Seuraavat toimittajat mainitaan hankintapäätöksissä tai muissa hankinta-asiakirjoissa:

Kuka? Mitä? Missä?
Hankintojen historia
Päivämäärä Asiakirja
2023-04-26 hankintailmoitus
2023-08-29 Ilmoitus tehdystä sopimuksesta
hankintailmoitus (2023-04-26)
Kohde
Hankinnan laajuus
Otsikko: Tutkimuslaboratorioiden palvelut
Viitenumero: 810/02 10 01 00 05/2023
Lyhyt kuvaus:
Luke is looking for a service provider for genotyping of rainbow trout individuals with a minimum of 20.000 SNP markers. The genotyping will be done for a total of 20.000 individuals during 2.5 years from the start of the contract. One service provider will be selected as a contract supplier. The procurement may be completely suspended if the budget set by the contracting entity for the procurement is exceeded.
Näytä lisää
Ilmoituksen metatiedot
Alkukieli: englanti 🗣️
Asiakirjatyyppi: hankintailmoitus
Sopimuksen luonne: Palvelut
Asetus: Euroopan unioni ja WTO-maat
Yhteinen hankintanimikkeistö (CPV)
Koodi: Tutkimuslaboratorioiden palvelut 📦
Suorituspaikka
NUTS-alue: Manner-Suomi 🏙️

Menettely
Menettelyn tyyppi: Avoin menettely
Tarjouksen tyyppi: Tarjous koskee kaikkia eriä
Myöntämisperusteet
Kokonaistaloudellisesti edullisin tarjous

Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Maa: Suomi 🇫🇮
Hankintaviranomaisen tyyppi: Kansallinen tai liittovaltiotason virasto/laitos
Hankintaviranomaisen nimi: Natural Resources Institute Finland
Postiosoite: P.O. Box 2 (Latokartanonkaari 9)
Postinumero: 00791
Postitoimipaikka: Helsinki
Yhteystiedot
Internetosoite: https://www.luke.fi/en 🌏
Sähköposti: kirjaamo@luke.fi 📧
Puhelin: +358 295326000 📞
Asiakirjojen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/luke?id=451253&tpk=d6972e16-8f14-458e-9d07-2623396dbeca 🌏
Osallistumisen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/luke?id=451253&tpk=d6972e16-8f14-458e-9d07-2623396dbeca 🌏

Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2023-04-26 📅
Tarjousten jättämisen määräaika: 2023-05-29 📅
Julkaisupäivä: 2023-04-28 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2023/S 084-250022
EUVL-S-numero: 84
Lisätietoja
The tenders will be opened electronically. Tenderers will not be able to participate in the opening.

Kohde
Hankinnan laajuus
Lyhyt kuvaus:
Luke is looking for a service provider for genotyping of rainbow trout individuals with a minimum of 20.000 SNP markers.
The genotyping will be done for a total of 20.000 individuals during 2.5 years from the start of the contract.
One service provider will be selected as a contract supplier.
The procurement may be completely suspended if the budget set by the contracting entity for the procurement is exceeded.
Arvioitu kokonaisarvo: 290 000 EUR 💰
Lyhyt kuvaus:
Luke is looking for a service provider for genotyping of rainbow trout individuals with a minimum of 20.000 SNP markers. The genotype data of individuals will be combined with their phenotypes to study, for example, the genomic inheritance of the fish traits, to determine genetic sex, and to perform genomic evaluations in selective breeding. To make powerful genomic analysis across generations and data sets, the genotype data produced by the service provider will be combined by Luke with the Luke's existing genotype data sets generated previously by AxiomTM Trout Genotyping Array (that has 57 501 SNP markers; 384 format). The samples sent to the service provider can be potentially used again by Luke in some future laboratory analysis, and hence they remain valuable for Luke even after the service providers has completed their analysis.
Näytä lisää
-The SNP panel to be used by the service provider should have a minimum of 20.000 SNP markers to ensure a reasonable coverage of the trout genome.
-Some of the SNP markers should be Y chromosome-specific SNPs near the sdY gene (male-specific in rainbow trout).
-Most of the 20.000 SNP markers need to be a subset of the SNP markers in the AxiomTM Trout Genotyping Array which has 57,501 markers.
-The data from the 20.000 markers needs to be equivalent with the data produced by the respective markers of AxiomTM Trout Genotyping Array.
-Luke will send fin tissue samples of individuals to the service provider in QR and bar-coded tubes (very few are in well plates). The samples will be sent in batches of around 2000-5000 fish. Luke covers the shipment costs.
The service provider will:
-Extract DNA from the individual fin clips,
-Generate SNP information on each fish,
-Return the remaining tissue of each sample in the form of homogenate or the tissue itself in the individual QR coded tubes,
-Cover the shipment costs of returning the samples,
-Return all genotype data to Luke in a digital form. In the data, each sample has an individual code of the tube to which the individual's SNP data will be connected.
Luke remains the owner of the data, and the service provider does not own the data.
Arvioitu arvo ilman arvonlisäveroa: 290 000 EUR 💰
Kesto: 30 kuukautta
Vaihtoehtojen kuvaus:
Optionally, among the contracted 20.000 tissue samples, some of the samples could be on Atlantic salmon and would be analysed for a minimum of 20.000 Atlantic salmon SNP markers.

Menettely
Oikeusperusta: 32014L0024
Tarjousten vastaanottoaika: 12:00
Kielet, joilla tarjoukset tai osallistumishakemukset voidaan jättää: suomi 🗣️
englanti 🗣️
Tarjouksen voimassaoloaika: 6 kuukautta
Tarjousten avauspäivä: 2023-05-29 📅
Tarjousten avausaika: 12:30
Lisätietoja:
The tenders will be opened electronically. Tenderers will not be able to participate in the opening.

Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Kansallinen rekisterinumero: 0244629-2
Yhteystiedot
Yhteyspiste: Registry
Asiakirjojen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/luke?id=451253&tpk=d6972e16-8f14-458e-9d07-2623396dbeca 🌏

Viite
Lisätietoja
The Natural Resources Institute Finland uses the Finnish government's common electronic order and invoice processing system, the Handi service. Purchases are allocated through the system to valid contracts and ordered through the electronic system.
The Natural Resources Institute Finland only approves, processes and archives invoices in electronic form that are compliant with the European Standard. Invoices are requested to be sent as an electronic invoice through OpusCapita Solutions Oy, which acts as the Finnish government's e-invoice operator. We will return the received paper invoices to the biller.
Näytä lisää
We require that the invoice include an order number or contract number so that our invoice processing system can automatically assign an invoice to the associated order.

Täydentävät tiedot
Arvostelurunko
Nimi: Markkinaoikeus
Postiosoite: Sörnäistenkatu 1
Postitoimipaikka: Helsinki
Postinumero: 00580
Maa: Suomi 🇫🇮
Puhelin: +358 295643300 📞
Sähköposti: markkinaoikeus@oikeus.fi 📧
Internetosoite: http://www.oikeus.fi/markkinaoikeus 🌏
Lähde: OJS 2023/S 084-250022 (2023-04-26)
Ilmoitus tehdystä sopimuksesta (2023-08-29)
Kohde
Hankinnan laajuus
Hankinnan kokonaisarvo: 290 000 EUR 💰
Ilmoituksen metatiedot
Asiakirjatyyppi: Ilmoitus tehdystä sopimuksesta

Menettely
Tarjouksen tyyppi: Ei sovelleta

Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2023-08-29 📅
Julkaisupäivä: 2023-09-01 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2023/S 168-524923
Viittaa ilmoitukseen: 2023/S 084-250022
EUVL-S-numero: 168
Lisätietoja
The Natural Resources Institute Finland uses the Finnish government's common electronic order and invoice processing system, the Handi service. Purchases are allocated through the system to valid contracts and ordered through the electronic system. The Natural Resources Institute Finland only approves, processes and archives invoices in electronic form that are compliant with the European Standard. Invoices are requested to be sent as an electronic invoice through OpusCapita Solutions Oy, which acts as the Finnish government's e-invoice operator. We will return the received paper invoices to the biller. We require that the invoice include an order number or contract number so that our invoice processing system can automatically assign an invoice to the associated order.
Näytä lisää

Menettely
Myöntämisperusteet
Laatukriteeri (nimi): Quality, delivery time
Laatukriteeri (painotus): 15
Laatukriteeri (nimi): Quality, starting time of the service
Laatukriteeri (painotus): 5
Laatukriteeri (nimi): Quality, analyzing the Atlantic salmon
Laatukriteeri (painotus): 10
Hinta (painotus): 70

Sopimuksen tekeminen
Sopimuksen tekemispäivä: 2023-07-13 📅
Nimi: Neogen Europe
Kansallinen rekisterinumero: GB 717 2081 53
Postiosoite: Auchincruive House, Auchincruive
Postitoimipaikka: Ayr
Postinumero: KA6 5HU
Maa: Iso-Britannia 🇬🇧
South Ayrshire 🏙️
Hankinnan kokonaisarvo: 290 000 EUR 💰
Tietoa tarjouskilpailuista
Saatujen tarjousten määrä: 2

Täydentävät tiedot
Arvostelurunko
Postiosoite: Radanrakentajankatu 5
Postinumero: 00520
Lähde: OJS 2023/S 168-524923 (2023-08-29)
Uudet hankinnat asiaan liittyvissä luokissa 🆕
Aiheeseen liittyvät haut 🔍
Alue:
Suomi/Finland Manner-Suomi
Tuotteet/palvelut:
Tutkimus- ja kehityspalvelut ja niihin... Tutkimuspalvelut ja kokeelliset kehityspalvelut Tutkimuspalvelut Tutkimuslaboratorioiden palvelut