WGS kirjastokitit

Lyhyt kuvaus

Hankinnan kohteena ovat sekä erilaisten mikrobien kokogenomisekvensoinnissa, amplikonisekvensoinnissa että
metagenomiikkasekvensoinnissa käytettävät kirjastokitit Terveyden ja hyvinvoinnin laitokselle (THL).

Hankinta on jaettu kahteen (2) osa-alueeseen seuraavasti:

Osa-alue 1: Virusten kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit
Osa-alue 2: Bakteerien kokogenomisekvensointiin (WGS) sopivat kirjastokitit

Hankinnan kohde on kuvattu tarkemmin tässä tarjouspyynnössä ja sen liitteissä. Tarjoaja voi tarjota vain yhtä tai molempia osa-alueita.

Kumpaankin osa-alueeseen valitaan yksi (1) toimittaja. Valintaperusteena on kokonaistaloudellinen edullisuus, jonka perusteena on paras hinta-laatusuhde.

Sopimuskausi on voimassa määräaikaisena kaksi (2) vuotta, jonka jälkeen sopimus jatkuu toistaiseksi voimassaolevana.


Tarjouspyyntö sisältää seuraavat liitteet:

Liite 1 Jyse 2014 Tavarat (päivitetty versio, huhtikuu 2022)
Liite 2a Osa 1 Virusten WGS Prosessikuvaus
Liite 2b Osa 1 Virusten WGS Testin suorittaminen
Liite 2c Osa 1 Virusten WGS Testin pisteytys
Liite 3a Osa 2 Bakteerien testattavat kannat ja ohjelmistot
Liite 3b Osa 2 Bakteerien WGS Prosessikuvaus
Liite 3c Osa 2 Bakteerien WGS Testin suorittaminen
Liite 3d Osa 2 Bakteerien WGS Testin pisteytys
Liite 4 Handi-palvelun kuvaus
Liite 5 Sopimusluonnos

Hankinnan kuvaus

THL:n virologian laboratoriossa sekvensoidaan virusgenomeja sekä seuranta- että valmiustoiminnan puitteissa. Potilas- ja jätevesinäytteiden luonteesta johtuen näytteiden viruspitoisuus voi olla pieni ja virusgenomit osittain degeneroituneita.

Virusten sekvensoinnissa käytettävät kirjastokitit sisältävät kitit, jotka soveltuvat amplikoni ja metagenomiikkasekvensointiin. Reagenssikitin tulee soveltua virusten WGS prosessikuvaukseen (liite 2a).

Nykyinen analyysimäärä on noin 2 400 näytettä/vuosi. Kulutus on tällä hetkellä laskusuuntainen, mutta se saattaa poikkeustilanteissa nousta merkittävästi.

Hankinnan kuvaus

Näitä kittejä tullaan käyttämään THL:n Asiantuntijamikrobiologian yksikössä bakteriologian tiimissä, bakteerien seuranta- ja epidemiaselvitystyössä käytettäviin kokogenomisekvensointiin perustuviin analyyseihin.

Tämä työ on monella bakteerilajilla akkreditoitua, joten reagensseilla tehtävän työn pitää täyttää kullekin bakteerilajille esitetyt laatuvaatimukset ja reagenssikitin tulee soveltua WGS prosessikuvaukseen (liite 3b).

Arvio hankittavasta määrästä on noin 1000 näytettä/vuosi.

Menettelyn tärkeimmät piirteet

Hankintaan sovelletaan julkisista hankinnoista ja käyttöoikeussopimuksista annettua lakia (1397/2016, jäljempänä hankintalaki).

Kyseessä on hankintalain 26 §:ssä tarkoitettu EU-kynnysarvon ylittävä hankinta. Hankintamenettelynä käytetään hankintalain 32 §:n mukaista avointa menettelyä. Avoin menettely on hankintamenettely, jossa hankintayksikkö julkaisee hankinnasta hankintailmoituksen ja asettaa saataville tarjouspyynnön ja jossa kaikki halukkaat toimittajat voivat tehdä tarjouksen.

Kilpailutus suoritetaan osa-alueen 1 ja 2 osalta kahdessa vaiheessa. Osa-alueiden osalta prosessikuvaus, testin suorittaminen ja testin pisteytys on kuvattu omilla liitteillään.


VAIHE 1

Saapuneiden tarjousten soveltuvuusvaatimukset ja tarjousten tarjouspyynnön mukaisuus tarkistetaan (sis. osa-alueiden yhteiset vähimmäisvaatimukset sekä osa-alueiden erilliset vähimmäisvaatimukset, kts. hankinnan kohteen kriteerit ).

Kaksi (2) hinnaltaan halvinta soveltuvuus- ja vähimmäisvaatimukset täyttävää tarjousta per osa-alue (mikäli tarjouksia on tämä määrä) valitaan vaiheeseen 2.

Mikäli soveltuvia tarjouksia on vain yksi, valintaperusteena on tarjoajan soveltuvuus ja tarjouspyynnön mukaisuus ja suoriutuminen testissä määriteltyjen minimivaatimusten mukaisesti.

Vaiheen 1 jälkeen tehdään päätös ja päätöksessä ilmoitetaan siitä, ketkä valitaan jatkoon ja ketkä tippuvat pois hankintamenettelystä.

VAIHE 2

Vaiheeseen 2 valittujen tarjoajien tulee toimittaa kitti veloituksetta testattavaksi.

Kahden halvimman tarjouksen (mikäli tarjouksia on tämä määrä) kitit per osa-alue testataan tämän tarjouspyynnön osa-alueiden liitteiden mukaisesti.

Testaustilanne ei ole julkinen.

Tarjous saa laatupisteitä sen mukaan, miten se toimii testissä. Parhaat pisteet hyväksyttävällä pistemäärällä saanut tarjoaja valitaan toimittajaksi.

Mikäli molempien toimittajien laatupisteet ovat samat, niin valituksi tulee se toimittaja, jolla on vaiheessa 1 halvin hinta.
Mikäli soveltuvia tarjouksia on vain yksi, valintaperusteena on tarjoajan soveltuvuus ja tarjouspyynnön mukaisuus. Kitti testataan ja tuotteen tulee suoriutua testissä määriteltyjen minivaatimusten mukaisesti.

Vaiheen 2 testaus kestää arviolta kolme (3) kuukautta. Hankintapäätös tehdään tämän jälkeen.

Hankintayksikkö varaa oikeuden muuttaa ilmoitettua aikataulua.

---

TARJOUSKILPAILUSSA KÄYTETTÄVÄ KIELI

Hankinta-asiakirjat ovat saatavilla suomen kielellä. Mikäli tarjoaja tarvitsee dokumentit
muulla kielellä, tarjoaja vastaa itse käännättämisestä ja sen kustannuksista. Tarjoukset on
laadittava suomen kielellä.

---

OHJEITA JA TIETOJA ESPD-LOMAKKEESTA

Ohjeita ESPD-lomakkeen täyttämiseen löytyy Tarjouspalvelu-tarjousportaalista:
http://tarjoajat.cloudia.fi/fi/support/solutions/folders/6000230873

ESPD-lomakkeesta Julkisten hankintojen neuvontayksikön sivuilla:
https://www.hankinnat.fi/eu-hankinta/ehdokkaiden-ja-tarjoajiensoveltuvuus/yhteineneurooppalainen-hankinta-asiakirja-espd

---

TARJOAJIEN SOVELTUVUUTTA KOSKEVIEN TODISTUSTEN TARKASTAMINEN

ESPD-lomake on alustava näyttö soveltuvuusvaatimusten täyttämisestä. Tarjoajan on
varauduttava Tilaajan pyynnöstä milloin tahansa hankintamenettelyn aikana toimittamaan
soveltuvuusvaatimuksia koskevia selvityksiä sekä tarjoajayrityksestä että mahdollisista
alihankkijoista tai ryhmittymän jäsenistä.

Tarjouskilpailun voittajalta/voittajilta tarkastetaan kaikki soveltuvuusvaatimuksiin liittyvät
todistukset.