Exome sequencing reagents - NGS library adapters and hybridization probes
Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiirin kuntayhtymä
This public tender process is for NGS Library Adapters (also "Adapters") and Hybridization Probes (also "Probes") used in the diagnostic whole exome sequencing (WES) NGS pipelines of HUSLAB, Laboratory of Genetics. The pipeline is used for preparing high quality sample libraries for Illumina NovaSeq 6000 sequencer. The HUSLAB WES workflow is based on a target enrichment step using hybridization probes to enrich DNA fragments originating from the genomic Regions of Interest ("RoI"). HUSLAB WES is used for high sensitivity variant detection of both germline and somatic DNA variations.
The Contracting Entity estimates that annual orders will be made for 2000 samples (estimation for 2022 and HUS estimates, that the number of samples is rising) divided in three to four (3-4) different separate orders.
The tender is devided into two lots:
1) NGS Library Adapters
2) Hybridization Probes
The procurement entity selects one supplier for both lots so that the lot may have either the same or a different supplier.
INTENDED USE
The Adapters and the Probes offered will be Components of the HUSLAB WES process. HUSLAB will select the Components and combine them in order to create the final HUSLAB WES process used for generation of high quality and high sensitivity customized WES sample libraries, fulfilling the Special Requirements for High Sensitivity Variant Detection.
The WES pipelines using the Adapters and the Probes are used for production of high quality WES sample libraries from DNA isolated from:
- whole blood
- freshly isolated or frozen tissue samples or cells
- FFPE samples (optionally omitting DNA fragmentation)
- cell-free DNA (omitting input DNA fragmentation)
The NGS pipelines using the Components allow for HUSLAB to build NGS pipelines fulfilling the accreditation requirements of SFS-EN ISO 15189:2012.
Please see paragraph II.2.4 for detailed description and Annex 1.1.1 for description of the steps of the current HUSLAB WES laboratory process and The Special Requirements for High Sensitivity Variant Detection. Annex 1.1.1 applies to both lots 1 and 2.
Tarjousten vastaanottamisen määräaika oli 2022-04-08. Hankinta julkaistiin 2022-03-01.
ToimittajatSeuraavat toimittajat mainitaan hankintapäätöksissä tai muissa hankinta-asiakirjoissa:
Kuka? Mitä? Missä?| Päivämäärä | Asiakirja |
|---|---|
| 2022-03-01 | hankintailmoitus |
| 2022-11-08 | Ilmoitus tehdystä sopimuksesta |
Kohde
Hankinnan laajuus
Otsikko: Laboratorioreagenssit
Lyhyt kuvaus:
“This public tender process is for NGS Library Adapters (also "Adapters") and Hybridization Probes (also "Probes") used in the diagnostic whole exome...”
Ilmoituksen metatiedot
Alkukieli: englanti 🗣️
Asiakirjatyyppi: hankintailmoitus
Sopimuksen luonne: Tavarat
Asetus: Euroopan unioni ja WTO-maat
Yhteinen hankintanimikkeistö (CPV)
Koodi: Laboratorioreagenssit 📦
Lisä-CPV-koodi: Laboratorioreagenssit 📦
Suorituspaikka
NUTS-alue: Suomi/Finland 🏙️
Manner-Suomi 🏙️
Menettely
Menettelyn tyyppi: Avoin menettely
Tarjouksen tyyppi: Tarjous koskee kaikkia eriä
Myöntämisperusteet
Kokonaistaloudellisesti edullisin tarjous
Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Maa: Suomi 🇫🇮
Hankintaviranomaisen tyyppi: Julkisoikeudellinen yhteisö
Hankintaviranomaisen nimi: Helsingin ja Uudenmaan Sairaanhoitopiirin kuntayhtymä
Postiosoite: Uutistie 5 (PL 441)
Postinumero: 01770
Postitoimipaikka: Vantaa)
Yhteystiedot
Internetosoite: http://www.hus.fi 🌏
Sähköposti: jarkko.palokangas@ptcs.fi 📧
Asiakirjojen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/huslogistiikka?id=358007&tpk=547acce3-29f6-458f-b9b7-cc138778cd11 🌏
Osallistumisen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/huslogistiikka?id=358007&tpk=547acce3-29f6-458f-b9b7-cc138778cd11 🌏
Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2022-03-01 📅
Tarjousten jättämisen määräaika: 2022-04-08 📅
Julkaisupäivä: 2022-03-04 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2022/S 045-114338
EUVL-S-numero: 45
Lisätietoja
“The times given in the call for tenders are given in Finnish time. The date of the opening of tenders is a preliminary date. The opening of tenders is not public.”
Kohde
Hankinnan laajuus
Lyhyt kuvaus:
“This public tender process is for NGS Library Adapters (also "Adapters") and Hybridization Probes (also "Probes") used in the diagnostic whole exome...”
“The Contracting Entity estimates that annual orders will be made for 2000 samples (estimation for 2022 and HUS estimates, that the number of samples is...”
Näytä lisää (13)
“The tender is devided into two lots:”
“1) NGS Library Adapters”
“2) Hybridization Probes”
“The procurement entity selects one supplier for both lots so that the lot may have either the same or a different supplier.”
“INTENDED USE”
“The Adapters and the Probes offered will be Components of the HUSLAB WES process. HUSLAB will select the Components and combine them in order to create the...”
“The WES pipelines using the Adapters and the Probes are used for production of high quality WES sample libraries from DNA isolated from:”
“- whole blood”
“- freshly isolated or frozen tissue samples or cells”
“- FFPE samples (optionally omitting DNA fragmentation)”
“- cell-free DNA (omitting input DNA fragmentation)”
“The NGS pipelines using the Components allow for HUSLAB to build NGS pipelines fulfilling the accreditation requirements of SFS-EN ISO 15189:2012.”
“Please see paragraph II.2.4 for detailed description and Annex 1.1.1 for description of the steps of the current HUSLAB WES laboratory process and The...”
Osan numero: 1
Lyhyt kuvaus:
“The following components are requested for the HUSLAB WES process using Illumina Novaseq 6000 sequencer:”
“- Adapters for Novaseq 6000 compatible paired-end libraries containing unique dual indexes (UDI) for at least 384 different samples, also carrying unique...”
Näytä lisää (2)
“The requirements for the procurement are described in the paragraph "Procurement object criteria".”
“Please see also Annex 1.1.1.”
Uudistusten kuvaus:
“The Contract is in force for a Fixed Period of two (2) years, and thereafter until terminated.”
Osan nimi: Hydralization Probes ("Probes")
Osan numero: 2
Lyhyt kuvaus:
“- Biotinylated Hybridization Probes capturing both template strands. The Probes must be customizable to genomic regions of interest of HUSLAB (HUSLAB RoI)...”
Oikeudelliset, taloudelliset, rahoitukselliset ja tekniset tiedot
Osallistumisehdot
Kelpoisuus harjoittaa ammattitoimintaa:
“Selection criteria as stated in the procurement documents.”
Menettely
Oikeusperusta: 32014L0024
Tarjousten vastaanottoaika: 13:00
Kielet, joilla tarjoukset tai osallistumishakemukset voidaan jättää: englanti 🗣️
Tarjouksen voimassaoloaika: 6 kuukautta
Tarjousten avauspäivä: 2022-04-08 📅
Tarjousten avausaika: 13:01
Lisätietoja:
“The times given in the call for tenders are given in Finnish time. The date of the opening of tenders is a preliminary date. The opening of tenders is not public.”
Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Kansallinen rekisterinumero: 1567535-0
Yhteystiedot
Yhteyspiste: Jarkko Palokangas
Asiakirjojen URL-osoite: https://tarjouspalvelu.fi/huslogistiikka?id=358007&tpk=547acce3-29f6-458f-b9b7-cc138778cd11 🌏
Täydentävät tiedot
Arvostelurunko
Nimi: Markkinaoikeus
Postiosoite: Sörnäistenkatu 1
Postitoimipaikka: Helsinki
Postinumero: 00580
Maa: Suomi 🇫🇮
Puhelin: +358 295643300 📞
Sähköposti: markkinaoikeus@oikeus.fi 📧
Internetosoite: http://www.oikeus.fi/markkinaoikeus 🌏
Lähde: OJS 2022/S 045-114338 (2022-03-01)
Kohde
Hankinnan laajuus
Lyhyt kuvaus:
“This public tender process was for NGS Library Adapters (also "Adapters") and Hybridization Probes (also "Probes") used in the diagnostic whole exome...”
Hankinnan kokonaisarvo: 617 600 EUR 💰
Ilmoituksen metatiedot
Asiakirjatyyppi: Ilmoitus tehdystä sopimuksesta
Menettely
Tarjouksen tyyppi: Ei sovelleta
Myöntämisperusteet
Alin hinta
Hankintaviranomainen
Tunnistetiedot
Postitoimipaikka: Vantaa
Yhteystiedot
Sähköposti: kilpailutus.laboratorio@hus.fi 📧
Viite
Päivämäärät
Lähetyspäivä: 2022-11-08 📅
Julkaisupäivä: 2022-11-11 📅
Tunnisteet
Ilmoituksen numero: 2022/S 218-627843
Viittaa ilmoitukseen: 2022/S 045-114338
EUVL-S-numero: 218
Kohde
Hankinnan laajuus
Lyhyt kuvaus:
“This public tender process was for NGS Library Adapters (also "Adapters") and Hybridization Probes (also "Probes") used in the diagnostic whole exome...”
Sopimuksen tekeminen
Sopimuksen tekemispäivä: 2022-07-05 📅
Nimi: Integrated DNA Technologies, BVBA
Kansallinen rekisterinumero: BE047329140701
Postiosoite: Interleuvenlaan 12A
Postitoimipaikka: Leuven
Postinumero: 03001
Maa: Belgia 🇧🇪
Hankinnan kokonaisarvo: 40 000 EUR 💰
Sopimuksen tekemispäivä: 2022-11-08 📅
Nimi: Roche Diagnostics Oy
Kansallinen rekisterinumero: 1947409-7
Postiosoite: Revontulenpuisto 2 C
Postitoimipaikka: Espoo
Postinumero: 02100
Maa: Suomi 🇫🇮
Hankinnan kokonaisarvo: 577 600 EUR 💰
Tietoa tarjouskilpailuista
Saatujen tarjousten määrä: 1
3
Lähde: OJS 2022/S 218-627843 (2022-11-08)